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Le CBN Massif central est placé sous la tutelle du Ministère chargé de l’environnement, par le biais des Directions régionales de l’environnement, de l’aménagement et du logement (DREAL), étroitement associées à la mise en œuvre de ses missions et de ses actions sur leurs territoires respectifs (Auvergne, Limousin, Rhône-Alpes). 

De fait, le CBN Massif central participe à l’application des politiques nationales en faveur de l’environnement, apporte son soutien technique dans le cadre d’expertise en matière de flore sauvage, de végétation et d’habitats naturels, et anime les programmes de connaissance et de conservation qui lui sont confiés par les DREAL.